CV

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Sébastien Rochette

Présentation

Je suis Chef de Projet Tech, avec une expertise en amélioration continue.

Avec plus de 10 ans d’expérience dans la Tech et la Data Science, j’aime garantir des livrables de qualité tout en rassemblant les équipes autour d’objectifs clairs. Depuis 2021, en tant que manager d’une équipe Tech, j’applique les principes du Lean Management pour améliorer la satisfaction client, accompagner mes collègues dans leur développement, et créer un environnement de travail motivant. Je souhaite aujourd’hui mettre mes compétences en gestion de projet, développement logiciel et leadership au service d’une organisation qui allie technologie et approche humaine.

Expérience professionnelle

2022 - 2024 : Responsable de production de services informatiques – ThinkR

Responsable de la production de services pour le développement de solutions logicielles et web sur mesure. Team leader avec une approche Lean, centrée sur l’humain et une exigence de qualité.

  • Estimation technique et financière des projets : Analyse des besoins clients, planification des ressources, et répartition des charges des équipes pour garantir des résultats alignés sur les attentes.
  • Management d’équipe et pilotage des projets : Promotion de la qualité des livrables et mise en place de pratiques d’amélioration continue, tant pour les produits que pour le développement personnel des collaborateurs.
  • Formation et intégration des nouvelles recrues : Mise en œuvre de processus d’accueil et de montée en compétences pour favoriser leur succès à long terme.
  • Développement de produits web fiables et robustes : Création de solutions intégrées avec R, documentées, testées, et livrées en continu aux utilisateurs.

Compétences clés : Gestion de projet informatique (planification, estimation budgétaire), Méthodologies Lean et amélioration continue, Management d’équipe et accompagnement RH, Développement et qualité logicielle (R, HTML, intégration continue), Communication avec les parties prenantes

2018 - 2021 : Chef de projet, consultant et formateur R - ThinkR

Chef de projet et formateur spécialisé en Data Science et développement logiciel à partir du langage R, engagé dans la conception de solutions open-source.

  • Gestion de projets clients : Planification, estimation, et suivi pour des clients publics et privés, avec une maîtrise des délais et du respect des cahiers des charges.
  • Tech Lead : Support technique et formation des membres de l’équipe, garantissant la livraison de solutions conformes aux attentes.
  • Développement d’applications web Shiny : Conception d’outils interactifs pour simplifier la visualisation et l’analyse de données complexes.
  • Automatisation des processus DevOps/DataOps : Documentation, API, tests automatisés, dockerisation, intégration et déploiement continus pour assurer l’usage et la pérennité des solutions.
  • Formation et communication : Animation de formations sur R pour des utilisateurs de tous niveaux, conférences nationales et internationales, et création de supports pédagogiques.

Compétences clés : Pilotage de projets informatiques, Expertise en Data Science et outils open-source (R, Shiny), DevOps/DataOps (CI/CD, automatisation des tests), Formation et pédagogie technique, Communication et vulgarisation

2016 - 2018 : Freelance - Formation et Consultance - StatnMap

Consultant indépendant en Data Science et cartographie, offrant des services personnalisés d’analyse et de formation.

  • Création de formations adaptées : Développement de supports sur mesure pour l’apprentissage des outils R, QGIS, et de la cartographie.
  • Analyse géospatiale : Réalisation de projets pour des organisations nécessitant une expertise en traitement et visualisation de données géographiques.
  • Diffusion des connaissances : Animation d’un site web dédié aux meilleures pratiques en R et cartographie, partageant conseils et outils avec la communauté.

Compétences clés : Analyse et visualisation de données géospatiales, Formation, Expertise en outils cartographiques (QGIS, R), Communication technique

2011 - 2016 : Chercheur en Modélisation des Distributions d’Espèces Marines - Ifremer, Brest

Chercheur en écologie marine, spécialisé dans le développement d’outils analytiques pour la gestion et la préservation des écosystèmes.

  • Modélisation des distributions d’espèces : Création de modèles pour guider les décisions en conservation marine.
  • Conception de cartes des habitats : Développement d’outils d’aide à la décision pour les acteurs de la préservation de la biodiversité.
  • Collaboration interdisciplinaire : Travail avec d’autres chercheurs pour produire des outils flexibles et adaptés.

Compétences clés : Modélisation environnementale et analyse de données, Collaboration interdisciplinaire, Communication scientifique, Gestion de projets de recherche appliquée

2011 : Post-Doctorat - SAHFOS, Plymouth, Grande-Bretagne

Recherche collaborative sur les interactions plancton-poisson dans les écosystèmes marins.

  • Analyse de données écologiques : Modélisation spatio-temporelle des espèces pour explorer les interactions trophiques.
  • Diffusion scientifique : Communication des résultats pour des applications en gestion durable des ressources marines.

Compétences clés : Modélisation quantitative, Communication scientifique, Collaboration internationale

2008 – 2011 : Doctorat en halieutique. Agrocampus Ouest, Rennes.

Recherche sur les impacts des perturbations anthropiques et environnementales sur les populations de soles.

  • Modélisation multi-échelles : Cycle de vie complet des soles, intégrant des facteurs écologiques et anthropiques.
  • Outils analytiques pour la gestion des stocks : Fourniture de modèles prédictifs aux décideurs.

Compétences clés : Analyse environnementale, Développement d’outils de modélisation, Communication de résultats scientifiques

2002 : Analyste de laboratoire. Cargill France, Saint-Nazaire

Analyse et contrôle qualité des graines et produits dérivés (tourteaux).

Compétences clés : Contrôle qualité, Technique d’analyse en laboratoire, Agro-alimentaire

Formation

  • 2021 : Management avec approche Lean, amélioration continue. Formation « Learning To Scale »
  • 2008 – 2011 : Doctorat en halieutique. Agrocampus Ouest, Rennes.
  • 2004 – 2007 : École d’ingénieur agronome. Spécialisation halieutique. Agrocampus Ouest (École Nationale Supérieure d’Agronomie de Rennes).
  • 2003 – 2004 : Ecole préparatoire. Concours ENITA et ENSA. Lycée Théodore Monod, Le Rheu.
  • 2001 – 2003 : Brevet de technicien supérieur. Biochimie. Lycée Notre-Dame, Le Mans.

Liste des publications

Présentations en conférences

=> https://github.com/statnmap/prez/

Here I store my presentations in conferences as PDF.

Contributions open-source

2019 Sébastien Rochette, & Marion Louveaux. (2019, January 25). VisualExpert: A Shiny web interface for expert image comparison (Version v0.0.1). Zenodo. http://doi.org/10.5281/zenodo.2549677

2018 Marion Louveaux, & Sébastien Rochette. (2018, October 19). mamut2r: a R package to import and visualize xml files from the MaMuT Fiji plugin (Version v0.0.2). Zenodo. http://doi.org/10.5281/zenodo.1467431

Marion Louveaux, & Sébastien Rochette. (2018, October 18). mgx2r: a R package for importing meshes and cell graph files from MorphoGraphX software (Version v0.0.2). Zenodo. http://doi.org/10.5281/zenodo.1466047

2017
Rochette S. (2017, September 18). SDMSelect: A R-package for cross-validation model selection and species distribution mapping. Zenodo. http://doi.org/10.5281/zenodo.894344
* Voir les articles de blog associés

Publications scientifiques

2017 Petit T., Bajjouk T., Mouquet P., Rochette S., Vozel B., Delacourt C. (2017). Hyperspectral remote sensing of coral reefs by semi-analytical model inversion – Comparison of different inversion setups. Remote Sensing of Environment, ISSN: 0034-4257, Vol: 190, Page: 348-365. https://doi.org/10.1016/j.rse.2017.01.004

Peck M. A., Arvanitidis C., Butenschön M., Canu D. M., Chatzinikolaou E., Cucco A., Domenici P., Fernandes J. A., Gasche L., Huebert K. B., Hufnagl M., Jones M. C., Kempf A., Keyl F., Maar M., Mahévas S., Marchal P., Nicolas D., Pinnegar J. K., Rivot E., Rochette S., Sell A. F., Sinerchia M., Solidoro C., Somerfield P. J., Teal L. R., Travers-Trolet M., Van De Wolfshaar K. E. (2017). Projecting changes in the distribution and productivity of living marine resources: A critical review of the suite of modeling approaches used in the large European project VECTORS. Estuarine, Coastal and Shelf Science. Volume 201, 5 February 2018, Pages 40-55. http://doi.org/10.1016/j.ecss.2016.05.019

2016
Louveaux, M., Rochette, S., Beauzamy, L., Boudaoud, A. and Hamant, O. (2016), The impact of mechanical compression on cortical microtubules in Arabidopsis: a quantitative pipeline. Plant J. Accepted Author Manuscript. doi:10.1111/tpj.13290
* Un article de blog sur la shiny-app associée à l’article
* La Shiny app à tester directement
* Le code de la R-shiny app

Peck Myron A., Arvanitidis Christos, Butenschön Momme, Canu Donata Melaku, Chatzinikolaou Eva, Cucco Andrea, Domenici Paolo, Fernandes Jose A., Gasche Loic, Huebert Klaus B., Hufnagl Marc, Jones Miranda C., Kempf Alexander, Keyl Friedemann, Maar Marie, Mahévas Stephanie, Marchal Paul, Nicolas Delphine, Pinnegar John K., Rivot Etienne, Rochette Sebastien, Sell Anne F., Sinerchia Matteo, Solidoro Cosimo, Somerfield Paul J., Teal Lorna R., Travers-Trolet Morgane, Van De Wolfshaar Karen E. (2016) Projecting changes in the distribution and productivity of living marine resources: A critical review of the suite of modeling approaches used in the large European project VECTORS. Estuarine, Coastal and Shelf Science, IN PRESS. http://doi.org/10.1016/j.ecss.2016.05.019

2015
Bajjouk Touria, Rochette Sébastien, Laurans Martial, Ehrhold Axel, Hamdi Anouar, Le Niliot Philippe (2015). Multi-approach mapping to help spatial planning and management of the kelp species L. digitata and L. hyperborea: Case study of the Molène Archipelago, Brittany. Journal Of Sea Research, 100, 2-21. http://dx.doi.org/10.1016/j.seares.2015.04.004

2014
Trancart Thomas, Rochette Sébastien, Acou Anthony, Lasne Émilien, Feunteun Éric (2014). Modeling marine shad distribution using data from French bycatch fishery surveys. Marine Ecology Progress Series, 511, 181-192. http://dx.doi.org/10.3354/meps10907

Lassalle Geraldine, Bourdaud Pierre, Saint-Beat Blanche, Rochette Sébastien, Niquil Nathalie (2014). A toolbox to evaluate data reliability for whole-ecosystem models: Application on the Bay of Biscay continental shelf food-web model. Ecological Modelling, 285, 13-21. Publisher’s official version : http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolmodel.2014.04.002 , Open Access version : http://archimer.ifremer.fr/doc/00188/29969/
* Model construction explanation

Nicolas Delphine, Rochette Sébastien, Llope Marcos, Licandro Priscilla (2014). Spatio-Temporal Variability of the North Sea Cod Recruitment in Relation to Temperature and Zooplankton. Plos One, 9(2), e88447. Publisher’s official version : http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0088447 , Open Access version : http://archimer.ifremer.fr/doc/00181/29250/

2013
Rochette Sébastien, Le Pape Olivier, Vigneau Joel, Rivot Etienne (2013). A hierarchical Bayesian model for embedding larval drift and habitat models in integrated life cycles for exploited fish. Ecological Applications, 23(7), 1659-1676. Publisher’s official version : http://dx.doi.org/10.1890/12-0336.1 , Open Access version : http://archimer.ifremer.fr/doc/00161/27243/
* OpenBUGS code of the model

2012
Rochette Sébastien, Huret Martin, Rivot Etienne, Le Pape Olivier (2012). Coupling hydrodynamic and individual-based models to simulate long-term larval supply to coastal nursery areas. Fisheries Oceanography, 21(4), 229-242. Publisher’s official version : http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-2419.2012.00621.x , Open Access version : http://archimer.ifremer.fr/doc/00085/19598/

Blanchet Aline, Dubois Stanislas, Hily Christian, Rochette Sébastien, Le Goaster Edouard, Guillou Monique (2012). Multi-decadal changes in two co-occurring ophiuroid populations. Marine Ecology-progress Series, 460, 79-90. Publisher’s official version : http://dx.doi.org/10.3354/meps09784 , Open Access version : http://archimer.ifremer.fr/doc/00090/20136/

2011
Cordier Mateo, Perez Agundez Jose A., O’Connor Martin, Rochette Sébastien, Hecq Walter (2011). Quantification of interdependencies between economic systems and ecosystem services: An input-output model applied to the Seine estuary. Ecological Economics, 70(9), 1660-1671. Publisher’s official version : http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolecon.2011.04.009 , Open Access version : http://archimer.ifremer.fr/doc/00041/15222/

Gascuel D., Bez Nicolas, Forest Andre, Guillotreau P., Laloe F., Lobry Jeremy, Mahevas Stephanie, Mesnil Benoit, Rivot Etienne, Rochette Sébastien, Trenkel Verena (2011). A future for marine fisheries in Europe (Manifesto of the Association Francaise d’Halieumetrie). Fisheries Research, 109(1), 1-6. Publisher’s official version : http://dx.doi.org/10.1016/j.fishres.2011.02.002 , Open Access version : http://archimer.ifremer.fr/doc/00035/14598/

Kostecki Caroline, Rochette S., Girardin R., Blanchard Michel, Desroy Nicolas, Le Pape Olivier (2011). Reduction of flatfish habitat as a consequence of the proliferation of an invasive mollusc. Estuarine Coastal And Shelf Science, 92(1), 154-160. Publisher’s official version : http://dx.doi.org/10.1016/j.ecss.2010.12.026 , Open Access version : http://archimer.ifremer.fr/doc/00035/14641/

2010
Rochette S., Rivot Etienne, Morin Jocelyne, Mackinson S., Riou Philippe, Le Pape Olivier (2010). Effect of nursery habitat degradation on flatfish population: Application to Solea solea in the Eastern Channel (Western Europe). Journal Of Sea Research, 64(1-2), 34-44. Publisher’s official version : http://dx.doi.org/10.1016/j.seares.2009.08.003 , Open Access version : http://archimer.ifremer.fr/doc/00008/11921/

2009
Rochette Sébastien, Lobry Jeremy, Lepage Mario, Boet Philippe (2009). Dealing with uncertainty in qualitative models with a semi-quantitative approach based on simulations. Application to the Gironde estuarine food web (France). Ecological Modelling, 220, 122-132. http://dx.doi.org/10.1016/j.ecolmodel.2008.09.017
* Model construction explanation
* Presentation of the paper is here

Données

2016
Caillaud M., Petton S., Dumas F., Rochette S., Vasquez M. (2016). Rejeu hydrodynamique à 500 m de résolution avec le modèle MARS3D-AGRIF - Zone Manche-Gascogne. IFREMER. http://doi.org/10.12770/3edee80f-5a3e-42f4-9427-9684073c87f5

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