J’ai modifié deux thèmes Hugo pour pouvoir partager du code R en utilisant Blogdown. hugo-future-imperfect et hugo-statnmap-theme sont des thèmes multilingues permettant le code-folding, la coloration syntaxique, une liste d’articles associés, les citations, les graph SEO ou un formulaire de …
Jouer avec des outils de cartographie sur des images 3D de cellules
Jouons avec les outils de cartographie sur des données non géographiques ! {rayshader} est cool sur les raster, mais pourquoi ne pas l’utiliser sur des cellules végétales segmentées ? […] Je voulais trouver une bonne raison de jouer avec les packages de Tyler Morgan-Wall pour la visualisation …
Initiation à la cartographie avec {sf} & Co.
Aux “Rencontres R 2018” à Rennes, j’ai proposé une brève introduction à la cartographie en utilisant le récent package {sf} et quelques autres packages intéressant. Ce post de blog est une version enrichie de ma présentation et me permet de partager le code des différentes cartes qui y figurent. …
Dessiner des cartes comme des peintures
Sur la Slack Grrr, une Slack d’entraide francophone sur R, Thomas Vroylandt nous a montré les cartes ci-dessous en demandant si c’était possible de les faire avec {ggplot2} : EDIT : Ces cartes viennent à l’origine du site web visionscarto.net avec des oeuvres d’Agnès Stienne Romain Lesur a rappelé …
Corrélation spatiale entre rasters
Dans cet article de blog, je propose une façon d’aborder la répartition spatiale de la corrélation entre deux rasters. Quelque soit votre raison, vous pourriez vouloir connaître la corrélation entre des rasters, sauf qu’une valeur unique issue de la fonction cor n’est pas suffisante. Vous aimeriez …
Afficher / cacher les zones de code avec bookdown et blogdown
J’ai passé des thèmes Hugo avec du code folding, retrouvez la liste ici. […] Il y a quelque temps, j’ai répondu à une question sur stackoverflow pour activer le pliage de code avec bookdown. Bien que cette réponse fonctionne, je n’étais pas totalement satisfait du comportement du bouton …
Interpolation spatiale sur le globe terrestre 3D
La carte de la Terre est habituellement présentée à plat. Les coordonnées géographiques vont généralement de -180° à +180°. Les interpolations spatiales qui utilisent directement les coordonnées géographiques peuvent être compliquées car -180° est égal à +180°. Je propose ici une façon de réaliser …
Migration de wordpress à Hugo avec Blogdown
J’ai utilisé le thème hugo-icarus de digitalcraftsman comme base et déplacé différentes choses. J’ai ajouté de quoi avoir un blog et ma présentation de freelance. N’hésitez pas à le “fork” ou à proposer vos “pull requests”. Le thème “hugo-statnmap-theme” a les fonctionnalités suivantes : […] …
Traduction d'un document rmarkdown à partir d'un tableau
Dans mon article “Rmarkdown avec conditions pour créer des pdf et html en différentes langues et avec des images”, je propose un moyen de créer des documents rmarkdown qui peuvent produire des documents identiques en plusieurs langues. Si vous travaillez avec plus de deux langues, la lecture du …
SDMSelect: Sélection de modèle par validation croisée et cartographie des distributions d'espèces
Cette librairie a été initialement conçue pour la sélection de covariables en vue d’ajuster des modèles d’habitat (biomasses, densités ou présence/absence). Son objectif premier est donc de produire des cartes de prédiction de distributions (cf. vignette SDM_Selection). Cependant, le coeur de la …