Ça fait un moment depuis mon dernier article de blog. En ce moment mon temps libre est utilisé pour améliorer des packages comme “{fusen} : Gonflez votre package à partir d’un simple Rmd plat” , “{attachment} : Tools to deal with dependencies in scripts, Rmd and packages” ou “{gitlabr} : An R client …
cartographie
Enquête Kaggle 2018: Cartes des langages de programmation et répartition des problèmes de reproductibilité
L’an dernier, j’ai participé à un défi d’analyse des données de l’enquête Kaggle. L’objectif du défi : raconter une histoire sur les données d’un sous-ensemble de la communauté de la science des données représentée dans cette enquête, par une combinaison de texte narratif et d’exploration de …
Jouer avec des outils de cartographie sur des images 3D de cellules
Jouons avec les outils de cartographie sur des données non géographiques ! {rayshader} est cool sur les raster, mais pourquoi ne pas l’utiliser sur des cellules végétales segmentées ? […] Je voulais trouver une bonne raison de jouer avec les packages de Tyler Morgan-Wall pour la visualisation …
Initiation à la cartographie avec {sf} & Co.
Aux “Rencontres R 2018” à Rennes, j’ai proposé une brève introduction à la cartographie en utilisant le récent package {sf} et quelques autres packages intéressant. Ce post de blog est une version enrichie de ma présentation et me permet de partager le code des différentes cartes qui y figurent. …
Dessiner des cartes comme des peintures
Sur la Slack Grrr, une Slack d’entraide francophone sur R, Thomas Vroylandt nous a montré les cartes ci-dessous en demandant si c’était possible de les faire avec {ggplot2} : EDIT : Ces cartes viennent à l’origine du site web visionscarto.net avec des oeuvres d’Agnès Stienne Romain Lesur a rappelé …
Corrélation spatiale entre rasters
Dans cet article de blog, je propose une façon d’aborder la répartition spatiale de la corrélation entre deux rasters. Quelque soit votre raison, vous pourriez vouloir connaître la corrélation entre des rasters, sauf qu’une valeur unique issue de la fonction cor n’est pas suffisante. Vous aimeriez …
Interpolation spatiale sur le globe terrestre 3D
La carte de la Terre est habituellement présentée à plat. Les coordonnées géographiques vont généralement de -180° à +180°. Les interpolations spatiales qui utilisent directement les coordonnées géographiques peuvent être compliquées car -180° est égal à +180°. Je propose ici une façon de réaliser …
SDMSelect: Sélection de modèle par validation croisée et cartographie des distributions d'espèces
Cette librairie a été initialement conçue pour la sélection de covariables en vue d’ajuster des modèles d’habitat (biomasses, densités ou présence/absence). Son objectif premier est donc de produire des cartes de prédiction de distributions (cf. vignette SDM_Selection). Cependant, le coeur de la …
Un halo teinté à l’intérieur d’un polygone avec leaflet et la librairie sf (simple feature)
Récupérons les polygones des régions françaises et attribuons une couleur à chacune. J’aime bien les couleurs piratepal de la librairie yarrr. […] Pour créer ces fameux doughnuts à partir des polygones d’origine et des polygones tampons, j’ai utilisé la fonction st_difference. Cependant, …
Comment remplir un polygone avec des trous par une zone hachurée dans leaflet
J’ai créé un package R, disponible sur mon github statnmap, pour proposer la fonction hatched.SpatialPolygons. Cette fonction a été créée à partir de la fonction de base pour dessiner les SpatialPolygons de la librairie sp. J’ai retiré de la fonction tout ce qui permettait de dessiner directement. …
Dessiner un motif d’images répétées sur une carte dans un polygone
Définissons d’abord un SpatialPolygonDataFrame avec lequel travailler. Définissons aussi un polygone dans lequel dessiner la forêt. […] Il est possible d’échantillonner des points sur une grille régulière dans un polygone « spatial » avec la fonction sp::spsample. On peut ensuite afficher sur …
Inclure plusieurs couches dans un widget leaflet avec R
La librarie leaflet s’intègre très bien avec l’écriture façon “pipe” (%>%). Il est donc très facile d’ajouter de multiple couches spatiales dans un widget leaflet. Pour ajouter de nombreuses couches spatiales à votre widget, il n’est pas nécessaire d’utiliser une fonction comme “addPolygons” pour …
Cartographie, analyses spatiales et SIG avec R
La présentation date de 2012. Il y a pu y avoir quelques modifications dans les fonctions. Par exemple, dans la librairie “sp”, la fonction overlay() s’appelle désormais over().